財團法人農業科技研究院(簡稱農科院) 於民國103年由行政院農業委員會(簡稱農委會；現為農業部)全額捐助設置成立，致力推動農業科技產業化、技術商品化、投資事業化與行銷國際化。農科院積極與農委會轄下所屬試驗改良場(所)合作，整合農業技術研發量能、產品量產技術開發、智財保護與布局，以及品牌設計與市場行銷等資源，鏈結上中下游關鍵資源，全力以科技強化我國農業產業競爭力。

本院前身係於民國59年由聯合國協助我國成立之「台灣養豬科學研究所」，民國83年依農委會函示改制為「財團法人台灣養豬科學研究所」、民國90年經農委會同意更名為「財團法人台灣動物科技研究所」，103年為因應農業貿易自由化與國際化之全球社經局勢變動，再經農委會規劃組織架構，遴聘原服務於財團法人台灣動物科技研究所且配合農委會推動農業科技產業化政策，以及執行農業科技研發成果商品化及事業化政策專案辦公室之人員，改制為「財團法人農業科技研究院」，配合政策打造台灣創新農業科技產業，帶動農企業與農民合作開創全民農業。

本院設有動物科技研究所、植物科技研究所、水產科技研究所、產業發展中心及農業政策研究中心等三所兩中心，發展以科技為後盾，市場為導向之優勢農業，以農業科技創新產業價值鏈，發展高價值產業，引領農業持續創新與國際化，開創農業發展新契機。

一、強化農業科技研發成果加值應用，開發產業關鍵技術與平台。
二、推動農業科技產業鏈連結合作、服務及人才培育。
三、強化新創事業輔導能量與行銷媒合。
四、推動農業科技產業國際合作、資源開發與整合及行銷傳播。
五、應用生物資源開發飼料添加劑、生物農藥及生物肥料等農用資材。
六、推動動物用疫苗、生物農藥等潛力產業發展。
七、改善經濟動物生產體系，協助供應健康安全畜產品。
八、提供國內外委託試驗服務。
九、提供檢測檢驗技術服務，促成產業發展。
十、促進國內外動植物有關之產業科技及產業策進相關之教育訓練與成果交流。